DBA: "¡Alguien come demasiado!"

El tema del "aumento de tamaño" de tablas e índices debido a la implementación de MVCC es un punto delicado para los usuarios y administradores de PostgreSQL.





Una vez lo planteé en el artículo "DBA: When VACUUM Fails - We Clear the Table Manually" , habiendo analizado con ejemplos específicos cuán dramático puede tener el efecto en el rendimiento de la consulta en el rendimiento de la consulta si la transacción no se ejecutó a tiempo o se desperdició debido a transacciones concurrentes VACUUM



.





Pero, además del efecto sobre la velocidad, también está el hecho del efecto sobre el lugar ocupado. Probablemente se sorprenderá mucho si una mesa con un solo registro "en vivo", después de una pasada exitosa, autovacuum



continúa ocupando gigabytes de espacio en SSD costosos.





Hoy haremos una pequeña investigación sobre la estructura del almacenamiento de datos en archivos y profundizaremos en el pg_catalog



esquema que describe la base de datos PostgreSQL para comprender cómo identificar tablas que claramente ocupan una cantidad de espacio sospechosamente grande .





, PostgreSQL 12, - MVCC.





CREATE TABLE bloat AS SELECT 0 i;

CREATE INDEX ON bloat(i);

--    ""  pg_temp,     
CREATE OR REPLACE PROCEDURE pg_temp.upd() AS $$
  UPDATE bloat SET i = i + 1;
$$ LANGUAGE sql; --  ,  plainSQL-,   

DO $$
DECLARE
  i integer;
  ts timestamp;
BEGIN
  FOR i IN 1 .. 1 << 14 LOOP
    ts := clock_timestamp();
    CALL pg_temp.upd();
    RAISE NOTICE '% : %', i, clock_timestamp() - ts;
  END LOOP;
END;
$$ LANGUAGE plpgsql;
      
      



, UPDATE



. ?





TABLE bloat;
      
      



  i
-----
16384
      
      



?





SELECT pg_relation_size('bloat');
-- 598016
      
      



... ! , , HOT-update. VACUUM



- !





VACUUM bloat;
-- ...  !
SELECT pg_relation_size('bloat');
-- 598016
      
      



, , PostgreSQL, :





  • - (pg_class.relfilenode



    )





  • , 1GB





  • () 8KB









"" VACUUM



(VACUUM FULL



) - , , , "" .





"" , "" - VACUUM



.





pg_catalog

pg_catalog - , - , , , , , ... , , Joel Jacobson. , :





  • pg_namespace - (schema)





  • pg_class - - , , matview, ...





  • pg_depend - , -





  • pg_attribute -





  • pg_statistic -





"" ( ):





  • (pg_depend



    ) (pg_namespace



    ) public



    ( pg_catalog



    information_schema



    )





  • (pg_class.relpages



    ) (pg_class.reltuples



    )





  • " " (pg_statistic



    ) (pg_attribute



    ) , NULL- (pg_statistic.stanullfrac



    ) (pg_statistic.stawidth



    ) (pg_attribute.attalign



    )





  • ""





, - ""?





PostgreSQL, 8KB. , , block_size:





SELECT current_setting('block_size')::integer;
-- 8192
      
      



, :





estructura de colocación de datos en una tabla
  • PageHeaderData



    - 24





  • ItemIdData



    - 4





  • HeapTupleHeaderData



    - 23 (32-bit -> 4 , 64-bit -> 8 )





, , 27 , :





Estructura HeapTupleHeaderData
HeapTupleHeaderData

, t_cid



t_xvac



C-union, 4 .





" " NULL'

NULL- . NULL- , HeapTupleHeaderData



23 "" .





8 NULL, 1 , 24 . 9, ... 2 , 25, 64-bit - 32 .





"" NULL .





, NULL , pg_statistic.stanullfrac



NULL- .





, , NULL, . -, , , sum/avg/min/max/count



.





! "", "SQL HowTo: 1000 ":





P = exp (suma (ln (...)))
P = exp(sum(ln(...)))

!

, , :





CREATE TABLE nobloat AS
SELECT 0 i;

CREATE INDEX ON nobloat(i);
      
      



-- objects-in-scheme
WITH dep AS (
  -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/catalog-pg-depend
  SELECT
    objid
  FROM
    pg_depend
  WHERE
    (
      refclassid
    , refobjid
    , classid
    ) = (
      'pg_namespace'::regclass
    , (
        -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/catalog-pg-namespace
        SELECT
          oid
        FROM
          pg_namespace
        WHERE
          nspname = 'public' -- schema
        LIMIT 1
      )
    , 'pg_class'::regclass
    )
)
-- objects
, cl AS (
  -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/catalog-pg-class
  SELECT
    oid
  , relname
  , relpages
  , reltuples
  FROM
    pg_class cl
  WHERE
    oid = ANY(ARRAY(TABLE dep)::oid[]) AND
    relkind IN ('r', 'm', 'p') -- relation | matview | partition
)
SELECT
  T.*
, cl.*
, CASE
    WHEN ratio >= 1 THEN (ratio - 1) * def.PAGESIZE
  END::bigint repack_effect_size
FROM
  (
    -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/storage-page-layout
    SELECT
      current_setting('block_size')::integer PAGESIZE
    , CASE
        WHEN version() ~ 'mingw32' OR version() ~ '64-bit' THEN 8
        ELSE 4
      END MAXALIGN
  ) def
, cl
, LATERAL (
    WITH cols AS (
      SELECT
        *
      , (sz + szq - 1) / szq * szq sza -- aligned size
      FROM
        (
            -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/catalog-pg-attribute
            -- https://postgrespro.ru/docs/postgresql/12/catalog-pg-statistic
            SELECT
              attname
            , attnum
            , coalesce(st.stanullfrac, 0) nfr
            , CASE
                WHEN attlen = -1 THEN
                  CASE
                    WHEN attstorage IN ('p', 'm') OR stawidth < 2048 THEN -- toast_tuple_target
                      stawidth
                    ELSE 8 -- len + toast_id
                  END
                ELSE attlen
              END sz
            , CASE attalign
                WHEN 'c' THEN 1
                WHEN 's' THEN 2
                WHEN 'i' THEN 4
                WHEN 'd' THEN 8
              END szq
            FROM
              pg_attribute at
            LEFT JOIN
              pg_statistic st
                ON (st.starelid, st.staattnum) = (at.attrelid, at.attnum)
            WHERE
              at.attrelid = cl.oid AND
              NOT at.attisdropped AND -- without dropped columns
              at.attnum > 0           -- without system columns (tableoid, ctid, ...)
            ORDER BY
              attnum
        ) T
    )
    SELECT
      CASE
        WHEN reltuples = 0 AND relpages = 0 THEN 1
        WHEN reltuples = 0 AND relpages > 0 THEN NULL
        ELSE
          relpages /
            ceil( -- need pages
              reltuples /
                (
                  (PAGESIZE - 24) / -- PageHeaderData
                    ceil(szt::double precision / reltuples)::bigint -- avg tuple size
                ) -- tuples-per-page
            )
      END ratio
    FROM
      (
        SELECT
          reltuples * 4 + -- ItemIdData
          (
            (reltuples - fnnt) * hdr_tuple_w_nulls + -- hdr, tuples w/nulls
            fnnt * hdr_tuple_wo_nulls                -- hdr, tuples wo/nulls
          ) +
          sztc szt -- size of tuples
        FROM
          (
            SELECT
              sztc
            , fnnt
              -- aligned headers
            , ceil(hdr_cols_sys::double precision / MAXALIGN)::integer * MAXALIGN hdr_tuple_wo_nulls
            , ceil((hdr_cols_sys + hdr_cols_null)::double precision / MAXALIGN)::integer * MAXALIGN hdr_tuple_w_nulls
            FROM
              (
                SELECT
                  -- https://doxygen.postgresql.org/htup__details_8h_source.html#l00121
                  -- 4 : t_xmin
                  -- 4 : t_xmax
                  -- 4 : t_cid | t_xvac
                  -- 6 : t_ctid
                  -- 2 : t_infomask2
                  -- 2 : t_infomask
                  -- 1 : t_hoff
                  23 hdr_cols_sys
                , ceil(count(*)::double precision / 8)::integer hdr_cols_null
                , sum(ceil(sza * reltuples * (1 - nfr))) sztc -- size of tuples cols
                , trunc(exp(sum(ln(CASE WHEN nfr < 1 THEN 1 - nfr ELSE 1 END))) * reltuples) fnnt -- full-not-null-tuples
                FROM
                  cols
              ) T
          ) T
      ) T
  ) T;

      
      



?





ratio |   oid | relname | relpages | reltuples | repack_effect_size
-------------------------------------------------------------------
   73 | 41333 | bloat   |       73 |        15 |             589824
    1 | 41337 | nobloat |        1 |         1 |                  0
      
      



, PostgreSQL , bloat



15 , 1, - ANALYZE



. , ratio



1.





- , "" :





  • VACUUM FULL





  • pg_repack





  • pgcompacttable








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